1.兩種控制系統：紅外傳感器（IR）或熱導傳感器（TCD）進行測量。兩種傳感器都是準確的，但都各有優缺點。熱導傳感器監控CO2濃度的工作原理是基于對內腔空氣熱導率的連續測量,輸入CO2氣體的低熱導率會使腔內空氣的熱導率發生變化,這樣就會產生一個與CO2濃度直接成正比的電信號。紅外傳感器（IR）它是通過一個光學傳感器來檢測CO2水平的。IR系統包括一個紅外發射器和一個傳感器，當箱體內的CO2吸收了發射器發射的部分紅外線之后，傳感器就可以檢測出紅外線的減少量，而被吸收紅外線的量正好對應于箱體內CO2的水平，從而可以得出箱體內CO2的濃度。由于IR系統是通過紅外線減少來確定箱內CO2濃度，而箱體內顆粒物能夠反射或部分吸收紅外線，使得IR系統對箱體內顆粒物的多少比較敏感，因此IR傳感器應用在含HEPA空氣過濾器的培養箱內比較合適，如BLLA（博翎）BC-160W水套式培養箱就是采用的HEPA過濾器配合高精度IR傳感器的配置；而BT-80氣套式培養箱采用的是高精度TCD傳感器。      
     2.CO2濃度均一性：此點與溫度均一性的要求類似，在此就不做贅述。
     3.CO2測量系統自動校準功能： 無論哪種CO2測量系統在使用一段時間后都會產生漂移，而產生漂移后直接會導致箱體內二氧化碳濃度不能穩定在我們的設定值，致使培養失敗，所以我們在這里強烈建議用戶在選購培養箱時必須要選擇帶有CO2測量系統自動校準功能的培養箱。  
     4.還有一種是配比式的CO2培養箱,這是一個傳統的控制方式,精度無法把握,按CO2和空氣調和比來控制CO2的量.主要適用在對CO2濃度要求不高的地方。